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深圳首例H5N6流感病例病毒基因確定
2015年12月29日,,深圳市報(bào)告了1例H5N6流感病例。1月3日,,筆者從深圳市疾控中心獲悉,經(jīng)全基因組序列分析結(jié)果顯示,,目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒,,本次報(bào)告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源,從生物信息學(xué)角度證實(shí)本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的,。
此次報(bào)告的H5N6流感病例為深圳首例,,全球第五例H5N6流感病例。病例出現(xiàn)后,,深圳市疾控中心與華大基因合作,,立即對(duì)患者咽拭子樣本和活禽市場外環(huán)境樣本分離出的H5N6流感病毒進(jìn)行基因測序。經(jīng)過晝夜奮戰(zhàn),,1月3日上午10時(shí),,完成了全基因組序列分析。
基因測序結(jié)果顯示,,患者樣本中H5N6病毒HA,、NA基因與2014年廣東省從鴨只中分離的H5N6病毒高度同源,同源性>98%,;與深圳2014年活禽市場外環(huán)境分離出的H5N6病毒高度同源,,同源性>98%;與深圳2015年12月份來自外環(huán)境標(biāo)本分離出的3株H5N6病毒高度同源,。
同時(shí),,患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年四川和廣東報(bào)告的2例H5N6流感病例的病毒高度同源,,同源性>98%,。患者樣本中H5N6病毒的內(nèi)部6個(gè)基因與本地外環(huán)境中H9N2病毒高度同源,,H9N2病毒為該病毒的內(nèi)部骨架供體,。患者樣本中H5N6病毒HA和NA基因分別來源于外環(huán)境中的H5N1病毒和H6N6病毒,。
經(jīng)過測序分析認(rèn)為,,目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒,本次報(bào)告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源,,從生物信息學(xué)角度證實(shí)本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的,。因此,減少人與活禽密切接觸的機(jī)會(huì),,可有效預(yù)防人感染H5N6流感,。其中一個(gè)重要的措施是切實(shí)推行活禽集中屠宰、冷鏈配送,、生鮮上市,。該措施在國際上被普遍認(rèn)可,,發(fā)達(dá)國家在上世紀(jì)二三十年代就開始推廣禽類生鮮上市,目前,,歐美,、日本等發(fā)達(dá)國家和我國港澳地區(qū)已實(shí)行生鮮禽類代替活禽上市。對(duì)于市民,,需要做到盡量不直接接觸和處理活禽,不食用病死禽,,不購買來源不明的禽鳥類產(chǎn)品,。
此外,深圳市疾控中心也發(fā)現(xiàn)感染人的基因來源比較復(fù)雜,,至少經(jīng)歷H5N1流感病毒與H6N6流感病毒的重配,,然后重配的H5N6流感病毒再與H9N2流感病毒重配,產(chǎn)生目前感染人的H5N6流感病毒,。具體的病毒重配過程,,還在深入研究中。(記者/向雨航 通訊員/馬起山)
編輯:趙彥
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