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首個(gè)染色體級(jí)別山蒼子基因組圖譜構(gòu)建成功

2020年04月08日 16:47 | 來源:科技日?qǐng)?bào)
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最新發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新

科技日?qǐng)?bào)北京4月7日電 (記者馬愛平 通訊員宋平 王舒琦)7日,,記者從中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院獲悉,該院日前在《自然·通訊》雜志在線發(fā)表重要成果:成功構(gòu)建全球首個(gè)染色體級(jí)別的高質(zhì)量山蒼子基因組圖譜,,并基于此揭示樟科物種進(jìn)化及其精油合成的分子機(jī)制,。

山蒼子是我國(guó)南方家喻戶曉的一種香樹,。2016年10月,,中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院亞林所研究團(tuán)隊(duì)啟動(dòng)了山蒼子基因組測(cè)序項(xiàng)目,經(jīng)過3年多努力完成項(xiàng)目,,獲得了大小為1.37G,、片段重疊群N50為607.34Kb的基因組。通過Hi-C技術(shù),,他們進(jìn)一步將基因組錨定到24條染色體上,,錨定率94.56%,獲得質(zhì)量?jī)?yōu)良的山蒼子基因組圖譜,。

中國(guó)科學(xué)院院士,、中國(guó)水稻研究所研究員錢前評(píng)價(jià):“目前,對(duì)樟科植物果實(shí)精油及精油主要成分單萜化合物的生物合成機(jī)理尚不清楚,,制約了樟科植物精準(zhǔn)育種,。林科院汪陽(yáng)東團(tuán)隊(duì)選擇樟科果實(shí)精油含量最豐富的物種——山蒼子為研究對(duì)象,構(gòu)建了山蒼子全基因組圖譜,并結(jié)合樟科20屬47代表種低蓋度基因組測(cè)序數(shù)據(jù)和16屬23代表種混合組織及花苞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),,揭示了單萜合酶基因家族在樟科中的演化,,有效促進(jìn)了樟科植物單萜化合物多樣性和特異性,對(duì)揭示樟科植物的生物學(xué)特性,、指導(dǎo)樟科遺傳育種研究特別是加速分子育種進(jìn)程具有指導(dǎo)作用,。”

據(jù)悉,,中國(guó)林科院亞林所副研究員陳益存,、博士趙耘霄、助理研究員高暝,,比利時(shí)根特大學(xué)博士后李臻,,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)博士王潔雨,清華大學(xué)博士劉可為是論文共同第一作者,;中國(guó)林科院亞林所研究員汪陽(yáng)東,、臺(tái)灣成功大學(xué)教授蔡文杰、福建農(nóng)林大學(xué)教授劉仲健,、根特大學(xué)教授Yves為共同通訊作者,。


編輯:李澤杰

關(guān)鍵詞:基因組 山蒼 蒼子 樟科

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