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14年,這項(xiàng)大科學(xué)計(jì)劃干了哪些事兒
全球每年約有70萬(wàn)例左右的新發(fā)肝癌病人,,其中35萬(wàn)例以上在中國(guó),。中國(guó)是肝病大國(guó),,同時(shí)也是肝癌大國(guó),。一直以來(lái),人類和肝病的斗爭(zhēng)不曾停歇,。
“得了肝癌不可怕,,怕的是其復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,要抑制腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,,需要對(duì)其表達(dá)的標(biāo)志蛋白分子進(jìn)行監(jiān)測(cè)和預(yù)警,。如果執(zhí)行肝臟基本代謝及解毒功能的蛋白質(zhì)表達(dá)量降低,而與腫瘤侵襲遷移相關(guān)蛋白質(zhì)分子群的表達(dá)量增高,,預(yù)示著患者預(yù)后較差,,是術(shù)后的重點(diǎn)監(jiān)測(cè)對(duì)象?!避娛驴茖W(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院研究員姜穎說(shuō),,在完成計(jì)劃“兩譜、兩圖,、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo)后,, 研究團(tuán)隊(duì)正在做的是對(duì)肝癌等疾病進(jìn)行蛋白質(zhì)組分子分型和個(gè)性化臨床診療及干預(yù)方案的制定。
而姜穎所說(shuō)的“計(jì)劃”,,是始于2004年由我國(guó)領(lǐng)銜主導(dǎo)的,,美、英,、法等17個(gè)國(guó)家頂尖科學(xué)家團(tuán)隊(duì)參與的“國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”,。上述研究成果,,近日將以論文形式刊發(fā)于國(guó)際知名期刊。
在10月27—29日召開(kāi)的2018世界生命科學(xué)大會(huì)上,,國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃亮相中國(guó)生命科學(xué)領(lǐng)域重大成果展示區(qū),。計(jì)劃目前進(jìn)展如何?我國(guó)又為何能牽頭實(shí)施這一生命科學(xué)領(lǐng)域的國(guó)際大科學(xué)計(jì)劃,?科技日?qǐng)?bào)記者就此展開(kāi)采訪,。
解密基因組,繞不開(kāi)蛋白質(zhì)組
說(shuō)到蛋白質(zhì)組計(jì)劃,,就不得不提到人類基因組,。2003年,隨著人類基因組計(jì)劃的完成,,人類基因的注釋與確認(rèn)成為生命科學(xué)面臨的重要任務(wù)之一,。
“基因組和蛋白質(zhì)組的關(guān)系,好比詞典與文章,、元素表與化工廠的關(guān)系,。”時(shí)任國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)委,、中科院院士賀福初說(shuō),,蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,想要解密基因組,,必須先系統(tǒng)認(rèn)識(shí)蛋白質(zhì)組,。
2002年,師從著名遺傳學(xué)家談家楨的賀福初院士率先提出人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,,并提出建立蛋白質(zhì)組“兩譜,、兩圖、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo),,得到了國(guó)際同行的廣泛響應(yīng),。
“我國(guó)牽頭的國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,作為國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的首批計(jì)劃之一被優(yōu)先啟動(dòng),,美國(guó)牽頭的是人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃,。”姜穎自2003年博士畢業(yè)后就投身人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,,如今已是團(tuán)隊(duì)核心人物,。她說(shuō),人類基因組計(jì)劃是以染色體進(jìn)行國(guó)際分工,,人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃則以人體的組織器官進(jìn)行劃分,。
之所以我國(guó)科學(xué)家將人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃首個(gè)目標(biāo)聚焦于肝臟,是因?yàn)橹袊?guó)有1.5億以上的肝炎病毒攜帶者,,每年死于病毒性肝炎及與病毒性肝炎相關(guān)的肝纖維化,、肝硬化和肝癌的人數(shù)占世界總數(shù)半數(shù)以上,每年醫(yī)療費(fèi)用逾千億元(占國(guó)民生產(chǎn)總值的1%以上),,控制肝病的發(fā)生發(fā)展和提高肝病患者的生活質(zhì)量迫在眉睫,。
該計(jì)劃通過(guò)對(duì)肝臟蛋白質(zhì)全景式、高通量和規(guī)?;难芯?,解析肝臟蛋白質(zhì)在生理、病理過(guò)程中的功能意義,,發(fā)現(xiàn)一批肝臟疾病的新型診斷標(biāo)志物,、藥物作用靶標(biāo)和創(chuàng)新藥物,為全面提高疾病預(yù)防診治水平,、降低醫(yī)療費(fèi)用提供有效手段,。
從1%跨越到30%,從參與走向引領(lǐng)
作為開(kāi)發(fā)疾病預(yù)防診治藥物和技術(shù)的直接靶體庫(kù),,人類蛋白質(zhì)組已成國(guó)際生物科技研發(fā)的戰(zhàn)略制高點(diǎn),。國(guó)家自然基金委、科技部“863”“973”計(jì)劃以及《國(guó)家中長(zhǎng)期科技規(guī)劃綱要》中,,都對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)研究予以持續(xù)支持,。
值得關(guān)注的是,在國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃中,,中國(guó)承擔(dān)其中30%的工作量,。而此前,中國(guó)參與由美國(guó)領(lǐng)導(dǎo)的人類基因組計(jì)劃,,僅承擔(dān)其中1%的工作任務(wù),。
從1%到30%的跨越,意味著中國(guó)在國(guó)際大科學(xué)計(jì)劃中從參與走向了引領(lǐng),,背后是中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)的厚積薄發(fā),。賀福初表示,在國(guó)家大力支持下,,中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)很快建立起比較完善和先進(jìn)的技術(shù)體系,,涌現(xiàn)出一批優(yōu)秀的蛋白質(zhì)組學(xué)科技人才,產(chǎn)出一批具有重大影響的科技成果,,較早地在國(guó)際上發(fā)出了自己的聲音,,有了更加重要和突出的話語(yǔ)權(quán),國(guó)際學(xué)術(shù)影響和地位不斷提升,。
“賀福初院士敏銳意識(shí)到蛋白質(zhì)組成為國(guó)際戰(zhàn)略資源競(jìng)爭(zhēng)點(diǎn),,如果不從源頭進(jìn)行創(chuàng)新占領(lǐng)制高點(diǎn),別人也不會(huì)跟著你的科學(xué)目標(biāo)和技術(shù)策略走,?!苯f告訴記者,,國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃的實(shí)施過(guò)程中,賀福初院士一再?gòu)?qiáng)調(diào)要做“頂天立地”的科學(xué),,科學(xué)價(jià)值和社會(huì)效益的原始創(chuàng)新,,是中國(guó)能夠引領(lǐng)世界科技發(fā)展的重要因素之一。
就在2010年,,國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃“兩譜,、兩圖、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo)初步實(shí)現(xiàn),。我國(guó)科學(xué)家歷時(shí)5年多的艱辛探索,,完成了人類肝臟蛋白質(zhì)組表達(dá)譜和修飾譜,繪制了蛋白質(zhì)相互作用連鎖圖和定位圖,?!叭龓?kù)”則是建立符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的肝臟標(biāo)本庫(kù)、發(fā)展規(guī)?;贵w制備技術(shù)并建立肝臟蛋白質(zhì)抗體庫(kù)和建立完整的肝臟蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù),。
數(shù)據(jù)資源共享,驅(qū)動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展
“隨著國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃的開(kāi)展,,我們的研究成果大多以論文,、專著形式發(fā)表,計(jì)劃中所構(gòu)建的數(shù)據(jù)資源全部開(kāi)放,、資源共享,。”談及計(jì)劃的目前進(jìn)展,,姜穎以“兩譜,、兩圖”為例表示,2010—2015年間,,研究人員將解析肝臟蛋白質(zhì)組的分辨率加深,、覆蓋率擴(kuò)大,可以鑒定更多以前“抓不到”的蛋白,?!耙郧皟H能鑒定六千多個(gè)蛋白質(zhì),現(xiàn)在我們可以鑒定到肝臟中一萬(wàn)多種蛋白質(zhì),。而2015年以后,,隨著蛋白質(zhì)組鑒定技術(shù)的通量化和微量化,我們有能力開(kāi)展大規(guī)模,、微量臨床樣本的蛋白質(zhì)組鑒定了,,與精準(zhǔn)醫(yī)療的聯(lián)系也越發(fā)緊密。”
姜穎親歷了中國(guó)蛋白質(zhì)組計(jì)劃從無(wú)到有,、從跟著人家干到牽頭引領(lǐng)的全過(guò)程,。讓她自豪的是,中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展可以應(yīng)用于我國(guó)重大疾病個(gè)性化治療方案的制定,,這是作為基礎(chǔ)研究科研人員最為欣慰的,。
“對(duì)126例肝癌及配對(duì)癌旁組織樣本的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)產(chǎn)出后,我們發(fā)現(xiàn),,目前臨床上認(rèn)為的早期肝癌患者,,其蛋白質(zhì)組構(gòu)成有很大不同,,可以據(jù)此分成三種不同的蛋白質(zhì)組亞型,,而不同亞型的患者,術(shù)后應(yīng)該對(duì)應(yīng)不同的治療方案,?!苯f說(shuō),科研人員監(jiān)測(cè)發(fā)現(xiàn),,早期肝癌病人在進(jìn)行手術(shù)切除后,,約30%的患者術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的危險(xiǎn)系數(shù)非常大,蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)會(huì)為病人提供相應(yīng)的候選靶向治療方案,。
十多年間,,國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃交出了一份傲人的成績(jī)單:成功構(gòu)建國(guó)際上質(zhì)量最高、規(guī)模最大的人類第一個(gè)器官——肝臟蛋白質(zhì)組的表達(dá)譜,、修飾譜,、連鎖圖及其綜合數(shù)據(jù)庫(kù);首次實(shí)現(xiàn)人類組織/器官轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的全面對(duì)接,;發(fā)現(xiàn)一批針對(duì)肝臟疾病,、惡性腫瘤等重大疾病的生物標(biāo)志物、潛在藥靶和蛋白質(zhì)藥物……
2014年,,經(jīng)過(guò)多年論證的中國(guó)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃在京啟動(dòng),,將分三個(gè)階段展開(kāi)。第一階段,,全面揭示肝癌,、肺癌、白血病,、腎病等十大疾病所涉及的主要組織器官的蛋白質(zhì)組,,了解疾病發(fā)生過(guò)程中蛋白質(zhì)組的主要異常改變,進(jìn)而研制診斷試劑,、篩選藥物,,力爭(zhēng)2018年底完成;第二階段,爭(zhēng)取覆蓋中國(guó)人的其他常見(jiàn)疾病,,提升中國(guó)人群疾病的防治水平,;第三階段,實(shí)現(xiàn)人類更多疾病的覆蓋,。
“沒(méi)有國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃這一大科學(xué)計(jì)劃的開(kāi)展,,就沒(méi)有現(xiàn)在蛋白質(zhì)組學(xué)的蓬勃發(fā)展和后續(xù)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的實(shí)施,也就沒(méi)有我國(guó)在該領(lǐng)域的全球影響力和主導(dǎo)地位,?!辟R福初表示,十多年間科研團(tuán)隊(duì)積累的技術(shù),、經(jīng)驗(yàn),、人才等,都是如今開(kāi)展人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃不可多得的寶貴財(cái)富,。
編輯:趙彥
關(guān)鍵詞:解密基因組 蛋白質(zhì)組 肝癌
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