1948年初,，國民黨政府宣布“本屆總統(tǒng),、副總統(tǒng)候選人，由本黨同志在國民大會中得依法聯(lián)署提名參加競選,?！背虧撟遭赓Y歷深,、威望高，擁有兩湖民意,，且治軍從政40年,，門生僚屬遍全國，決定參加副總統(tǒng)競選,。其親信,、僚屬積極為其出謀劃策，籌組競選班子，由何成浚,、賀耀祖主持,，籌集助選資金一億元，趕寫了《程朱理學(xué)的研究》,，以宣傳其政治主張,，并組織了“民主政治會”和“憲政實施協(xié)進會”，創(chuàng)辦了《民主論壇》雜志,，為其造勢,。程潛也以《相期無負平生》《國家與地方》《論婦女問題》《思想與教育》為題，頻頻向社會各界發(fā)表演講,，闡述其政治見解,。3月29日第一屆“國大”在南京開幕，程潛等連日分別招待“國大”代表,，分發(fā)其作品《養(yǎng)復(fù)園詩集》,，謂之為“以文會友”。程潛的競選委員會發(fā)言人宣稱：“最后勝利必歸最不雄辯然最誠實的人,?！?/span>

4月20日，“國大”主席團公告副總統(tǒng)候選人為孫科,、李宗仁,、程潛、于右任等6人,。蔣介石希望孫科當(dāng)選副總統(tǒng),，指使吳稚暉等提出“本黨同志參加正副總統(tǒng)的競選應(yīng)尊重本黨意志，由黨提名”,。這一做法,，引起幾位候選人的強烈不滿，李宗仁乘機拉攏程潛,、于右任結(jié)成“聯(lián)盟”,，共同抵制這項提議。

“國大”第一,、第二次副總統(tǒng)選舉投票后,，李宗仁、孫科,、程潛得票較多,，但均不足法定票數(shù)。蔣介石為了給孫科拉選票,，命賀衷寒,、袁守謙二人勸程潛退出競選，將選票讓給孫科，并表示事后將啟用程潛的助選人并負責(zé)補償程的全部競選費用,。程潛同李宗仁訂有“同盟”,，如今雖知自己競選無望，但不甘屈從蔣的意志,，不僅拒絕了蔣的要求,，當(dāng)晚8時，他還公開宣布：“本人已受命放棄繼續(xù)競選副總統(tǒng)”,。

程潛退出競選,，李宗仁跟著退選。孫科沒有了競選對象,，只得也聲明放棄,，“國大”被迫休會。蔣在輿論壓力下,，不得不做出讓步,。5日,，國民黨中央常委會派人向李宗仁,、孫科、程潛解釋誤會,，國大主席團也派人勸李宗仁,、孫科、程潛繼續(xù)參加競選,。27日,，李宗仁、程潛表示“一切可聽大會決定”,，決定仍繼續(xù)參加競選,，投票結(jié)果，李宗仁,、孫科得票較多,，程潛退出。

副總統(tǒng)競選后,，蔣介石為對付桂系,，仍需利用程潛，于是在外調(diào)白崇禧任華中“剿總”總司令的同時,，又任命程潛為長沙綏靖公署主任兼湖南省政府主席,，讓程潛兼軍、政兩職,，統(tǒng)馭湘,、贛兩省，以牽制桂系。

程潛是與共產(chǎn)黨人淵源頗深的國民黨將領(lǐng),。除林伯渠曾擔(dān)任程潛第六軍的黨代表,，彭德懷曾經(jīng)是程潛部的軍官，左權(quán),、陳賡等也曾經(jīng)是程潛湘軍所屬學(xué)生隊的學(xué)員,，值得一提的是，毛澤東在湖南新軍當(dāng)兵期間,，程潛是湖南督軍府的參謀部長,、軍事廳長，所以毛澤東后來一直尊稱其為“老上司”,。1945年8月28日,，毛澤東率中共代表團赴重慶參加國共和平談判時，程潛曾親往桂園拜訪毛澤東,，毛澤東也曾回訪,。交談中，毛澤東曾對程潛說：“您是國民黨資深望重的元老了,，應(yīng)該充分發(fā)揮自己的作用,，下屆行憲國大選舉時，您老可以參加副總統(tǒng)的競選嘛,！競選成功了,，可以為老百姓謀點利益；不成功,，也沒有什么,，可以回湖南去搞和平運動！”

1949年8月4日,，程潛從民族大義出發(fā),，與陳明仁領(lǐng)銜發(fā)表湖南“和平起義通電”，使湖南免遭戰(zhàn)禍,，走向歷史性轉(zhuǎn)折,。