2016年11月28日至12月28日,，中央第二環(huán)境保護(hù)督察組對上海市開展環(huán)境保護(hù)督察，該市的垃圾非法傾倒問題成為督察重點(diǎn),。

楊浦區(qū)綠化和市容管理局與無資質(zhì)的個人進(jìn)行口頭約定,，由其承運(yùn)處理生活垃圾,，部分垃圾非法跨省傾倒,；嘉定區(qū)安亭鎮(zhèn)黃渡環(huán)衛(wèi)所違規(guī)將生活垃圾及垃圾中轉(zhuǎn)站委托無資質(zhì)的上海康家有害生物防制有限公司管理,，并允許其違規(guī)將垃圾運(yùn)至外省處置,。

督察組還指出，上海市的垃圾滲濾液污染問題突出,，老港垃圾填埋場滲濾液處理設(shè)施升級改造工作滯后,，安亭生活垃圾處理廠無滲濾液處理設(shè)施,，每天大量滲濾液長期超標(biāo)排入污水管網(wǎng)；寶山區(qū)顧村垃圾堆場和閔行區(qū)朱家涇垃圾堆場已停運(yùn)十余年,，至今未完成封場,，滲濾液流入場外雨水溝或直排河道。

中央環(huán)保督察組還著重調(diào)查了上海的水污染問題,，并認(rèn)為,，以水環(huán)境為代表的生態(tài)環(huán)境質(zhì)量依然是影響上海城市整體發(fā)展的突出短板。這一問題的根源是一些部門降低了環(huán)保工作的標(biāo)準(zhǔn),。

國務(wù)院發(fā)布的水污染防治行動計劃要求,，長三角地區(qū)近岸海域匯水區(qū)域城鎮(zhèn)污水處理設(shè)施應(yīng)于2016年年底前全面達(dá)到一級A排放標(biāo)準(zhǔn)，但上海市2015年12月出臺的水污染防治行動計劃實(shí)施方案則將這項工作完成時限推遲到2020年年底,。

此外,，上海市水務(wù)局2015年11月印發(fā)《違法排放污水行政處罰裁量基準(zhǔn)(試行)》，將污水處理設(shè)施處于建設(shè)階段導(dǎo)致污水超標(biāo)排放的情形列為從輕處罰,，中央環(huán)保督察組認(rèn)為,，此舉違反了環(huán)境保護(hù)法的有關(guān)規(guī)定。

自降環(huán)保標(biāo)準(zhǔn)導(dǎo)致上海一些河段水質(zhì)下降,。2016年,，全市259個市級考核地表水監(jiān)測斷面中，有88個斷面為劣五類,，占34%,。2013年以來，寶山區(qū)水環(huán)境質(zhì)量呈現(xiàn)逐年惡化趨勢,，2015年河流和斷面水質(zhì)達(dá)標(biāo)率比2013年分別下降30.7%和20.7%,，16個考核斷面全部為劣五類。

在飲用水水源保護(hù)方面,，上海市未按照相關(guān)法律法規(guī)要求,，將閔行二水廠和奉賢三水廠取水口納入一級保護(hù)區(qū)范圍。黃浦江上游飲用水水源保護(hù)區(qū)仍然有100余臺浮吊船長期違法作業(yè),，部分浮吊船就在飲用水水源一級保護(hù)區(qū)內(nèi),。

上海市今天表示，截至2017年2月底,，督察組交辦的1893件環(huán)境問題舉報已全部辦結(jié),，責(zé)令整改895家，立案處罰926家,，罰款金額6211萬元,，拘留17人，約談545人,，問責(zé)56人,。